Một trong những mối quan ngại lớn nhất đối với quán ăn đêm là vấn đề vệ sinh. Do hoạt động vào khung giờ muộn, việc kiểm tra, giám sát của cơ quan chức năng gặp nhiều hạn chế. Nhiều quán ăn vỉa hè không đảm bảo quy chuẩn về bảo quản thực phẩm, nguồn nước, dụng cụ chế biến...Sáng sớm, khi sương mù còn giăng khắp lối mòn, chú Ba c